miRNA测序(二代)
的有关信息介绍如下:小RNA是一类内源性的具有调控功能的非编码RNA,主要包括miRNA、piRNA和siRNA等;它的功能主要是诱导基因沉默,参与基因转录后调控,在发育、病毒防御、造血过程、器官形成、细抱增殖和凋亡等环节起着重要调控作用。
小RNA测序目标:
1.miRNA长度,茎环结构,miRNA前体加工,靶基因结合位点和预测;
2.转录组和小RNA数据的联合分析。
一、技术流程
二、生物信息学分析内容
1.测序质量分析与统计、评估;
2.microRNA,rRNA,tRNA,intron,exon,snRNA,snoRNA注释;
3.microRNA的表达量差异分析;
4.microRNA表达模式聚类分析;
5.microRNA保守性分析;
6.microRNA与靶基因之间的调控,microRNA靶基因之间的新篇歌蛋白-蛋白相互作用网络分析;
施娃7.靶基因预测;
8.新miRNA预测。
三、结果展示
1.数据库使用
2.版图展示
四、样本要求
艺吐总量:〉4µgRNA;浓度:〉50ng/µL
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